人类蛋白质图谱v25为疾病研究带来突破性进展

[jlee42]

瞭解人類蛋白質組取決於知道蛋白質的位置及其相互作用方式。 新發佈的人類蛋白質圖譜（HPA）提供了跨越細
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胞、組織和血液的這些數據。
人類蛋白質圖譜對蛋白質組研究的重要性
人體中表達的全部蛋白質集合，通常稱為蛋白質組，是理解健康維持和疾病發生機制的核心。 研究人員需要詳細的地圖來顯示蛋白質在特定組織、細胞和血液中的位置，以便追蹤疾病機制或識別新的治療靶點。
HPA一直是該領域的關鍵開放資源，提供數千種人類蛋白質的基於抗體的圖像和表達數據。
然而，重要的缺口一直存在。 許多疾病和生命階段的血液蛋白質譜一直不完整，許多組織中的單細胞解析度數據仍然稀少。 蛋白質-蛋白質相互作用的結構資訊最近才開始整合。
這些元素的缺失限制了該圖譜在轉化醫學和精準醫學研究中的實用性。
最新發佈的人類蛋白質圖譜版本旨在擴展血液、細胞和組織的數據覆蓋範圍——增加了疾病分析、蛋白質相互作用結構和單細胞解析度的新功能。
人類蛋白質圖譜v25有哪些新內容？
HPA v25包含超過1000
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萬張手動註釋的生物圖像，以及從30萬個生物樣本中提取的超過60億次檢測數據，覆蓋細胞、組織、器官和血液中的蛋白質編碼基因。
在血液方面，HPA v25整合了Olink HT和SomaScan平臺在32個疾病佇列中的分析數據。 總體而言，該資源涵蓋了71種疾病，包括癌症、自身免疫病、傳染病、神經疾病和心血管疾病，以及追蹤兒童期、衰老和懷孕的健康佇列數據。
相互作用資源包括超過15,000種蛋白質的網路，以及基於AlphaFold3建模預測的23,000個蛋白質-蛋白質相互作用結構。
在單細胞領域，HPA v25增加了來自34種組織類型的數據，包括腎上腺、垂體、附睾和膀胱尿道，以及使用單核分析更新的主要組織（脂肪、心臟、骨骼肌、腎臟）。 單細胞數據集現在覆蓋154種細胞類型，代表了大多數人類細胞類型。
組織和亞細胞模組也通過八種新組織得到增強，如脈絡叢、輸出管、卵巢和胎盤階段，以及用於多重分析的新胰腺抗體面板和人類誘導多能幹細胞中的亞細胞定位數據。
人類蛋白質圖譜的意義
通過將蛋白質譜與特定疾病和生命階段聯繫起來，擴展版HPA支援轉化醫學和精準醫學研究。 蛋白質相互作用網路和單細胞數據的納入還允許研究人員在結構和細胞水準上研究蛋白質功能。
"HPA團隊自豪地發佈這一新版開放獲取的HPA，其中包含大量內部和外部生成的新數據。 特別是，新的人類疾病血液資源應該對所有對轉化醫學感興趣並致力於從發現邁向精準醫學的研究人員有價值，"HPA聯盟主任Mathias Uhlen博士表示。