開發GoT-Multi工具追蹤癌症演變和治療耐藥性

[jlee42]

一種由威爾康奈爾醫學院（Weill Cornell Medicine）和阿德萊德大學研究人員開發的新工具，顯著提升了同時監測單個癌細胞中多個基因突變並記錄基因活動的能力。
該技術現已能夠處理多種病理樣本並高效分析大量細胞，使研究人員對癌症向更高侵襲性和治療耐藥性演變的過程獲得了新見解。
此項研究發表在《Cell Genomics》期刊上。 名為GoT-Multi的創新工具代表了對其前身GoT（基因分型轉錄組，Genotyping of Transcriptomes）的重大改進。 儘管GoT具有開創性意義，但它在檢測特定基因突變、同時識別的突變總數方面存在局限，且僅限於使用新鮮或冷凍的組織樣本。
相比之下，GoT-Multi有效解決了這些挑戰，能夠處理經福馬
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該技術賦予我們強大的新能力來回答關於癌症演變的關鍵問題，從癌前病變的起始、惡性轉化，直至最終發展為治療耐藥性。

安娜· S·南博士（Dr. Anna S. Nam），研究共同資深作者、病理學和實驗室醫學助理教授，威爾康奈爾醫學院

該研究的另一位共同資深作者是阿德萊德大學表觀遺傳學中心（Adelaide Centre for Epigenetics）的副教授兼團隊負責人盧西亞諾·馬泰洛托博士（Dr. Luciano Martelotto）。 南博士實驗室的博士後研究員派克·米努博士（Dr. Minwoo Pak）和米爾卡·索蒂-西倫根博士（Dr. Mirca Saurty-Seerunghen）共同領導了此項工作。
南博士在2010年代末擔任丹·
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蘭道博士（Dr. Dan Landau）實驗室博士後研究員期間，主導了GoT工具的創建。
GoT和GoT-Multi被歸類為「單細胞多組學」工具，因其能從單個細胞中捕獲多層資訊。
為展示GoT-Multi的獨特能力，研究人員將其應用於組織樣本，包括此前無法分析的類型，這些樣本來自慢性淋巴細胞白血病患者，他們正向更具侵襲性的大B細胞淋巴瘤轉變，這一過程稱為里希特轉化（Richter Transformation）。
該工具使研究人員得以分析數萬個單個腫瘤細胞，監測二十多種不同基因突變的存在，並觀察這些突變如何與細胞活動相關聯。 部分突變表現為加速生長，而另一些則在癌症進展中促進炎症反應。 總體而言，GoT-Multi以前所未有的深度揭示了這種惡性演變過程。
目前，研究人員正將GoT-Multi應用於大量治療耐藥性淋巴瘤，並用於繪製其他癌症及癌前病變的進展圖譜。 團隊預計，基於GoT-Multi獲得的見解將為開發新型治療策略提供關鍵依據